266 ответов в этой теме

[Умный и красивый]

Вот так. Не понял только почему две таблички.
Похоже?
Наверное да. Только странно, что кожа intermediate почти 60%. Я думал они под этим что-то более темное имеют в виду. Я не бледный и не сильно белокожий, но и не смуглый.

Кто-нибудь заливал свои файлы на предиктор пигментации?
https://hirisplex.erasmusmc.nl
Как я понимаю, можно туда и фтдна-файл загнать?
Мне вот интересно, насколько данные по древнему ДНК реально показывают нам пигментацию кожи, к примеру. 
Вот по карте выходит, что монголы и российские монголоиды с Дальнего Востока темнокожие.

У Вас FamilyFinder? Какой файл нцжно загружать?

[Краки Нифлунг]

Да, FF. Только это как оказалось неправильно. Он всегда такой результат выдает. А участки, ответственные за пигментацию в FF отсутствуют. Разве, что частично. Кажется HERC2 там только есть. В общем, ошибся я тогда. А аллели вручную надо вбивать.

Зачем там "загрузить" непонятно.

[roaring]

https://www.nature.c...u49oKgniUafWg==

[Краки Нифлунг]

Это исследование ведь было уже. Чем-то новым дополнили?

[roaring]

Это исследование ведь было уже. Чем-то новым дополнили?

Не видел раньше, так что сказать не могу.

[Краки Нифлунг]

https://www.biorxiv....0.1101/712497v2

Летом было. Кажется даже в одном из разделов обсуждалось. Но то, что вы запостили  просто уже не препринт.

[roaring]

https://www.biorxiv....0.1101/712497v2
Летом было. Кажется даже в одном из разделов обсуждалось. Но то, что вы запостили  просто уже не препринт.

Ну значит пропустил как-то.

[Краки Нифлунг]

Ну значит пропустил как-то.

На генофонде выложили. Получается, что 
http://xn--c1acc6aaf.../?page_id=32208


 

Выходит, что римляне там особенно и следов то не оставили.

Чтобы исследовать соотношение между генетическими кластерами французской популяции и соседними европейскими популяциями, авторы использовали данные из  базы 1000 G European dataset.  Проанализировав эту базу, они выделили три популяции, которые можно считать популяциями-донорами для остальных: это Северо-Западная Европа (CEU), Италия (TSI) и Испания (IBS). Вклад этих популяций в разные генетические кластеры Франции они оценили методом SOURCEFIND. В обеих когортах оказалось, что доли этих трех европейских компонентов различны в разных кластерах. Вклад северо-западной Европы (CEU) был более выражен на севере, чем на юге Франции, где, соответственно, преобладает вклад южной Европы.  CEU преобладал в кластере северо-запад, TSI – в кластере юго-восток, а IBS был главным компонентом в кластере юго-запад. Авторы отмечают, что испанский компонент (IBS) может отражать генетический вклад басков.

[roaring]

На генофонде выложили. Получается, что http://xn--c1acc6aaf.../?page_id=32208
 

Выходит, что римляне там особенно и следов то не оставили.Чтобы исследовать соотношение между генетическими кластерами французской популяции и соседними европейскими популяциями, авторы использовали данные из  базы 1000 G European dataset.  Проанализировав эту базу, они выделили три популяции, которые можно считать популяциями-донорами для остальных: это Северо-Западная Европа (CEU), Италия (TSI) и Испания (IBS). Вклад этих популяций в разные генетические кластеры Франции они оценили методом SOURCEFIND. В обеих когортах оказалось, что доли этих трех европейских компонентов различны в разных кластерах. Вклад северо-западной Европы (CEU) был более выражен на севере, чем на юге Франции, где, соответственно, преобладает вклад южной Европы.  CEU преобладал в кластере северо-запад, TSI – в кластере юго-восток, а IBS был главным компонентом в кластере юго-запад. Авторы отмечают, что испанский компонент (IBS) может отражать генетический вклад басков.[/size]

Ну чтобы про Римлян говорить надо тестировать древних галлов и всех остальных жителей тогдашней Франции, вон по Испанцам недавно получилось под 30% Римского влияния.

[Краки Нифлунг]

Ну чтобы про Римлян говорить надо тестировать древних галлов и всех остальных жителей тогдашней Франции, вон по Испанцам недавно получилось под 30% Римского влияния.

 

Вот как? Тогда выходит, что IBS может отражать еще и римское влияние

[roaring]

Вот как? Тогда выходит, что IBS может отражать еще и римское влияние

 

Попробую сегодня найти модели по иберийцам.

[Умный и красивый]

[roaring]

https://i4.imageban....33b3658493d.jpg

[Kurš]

В последнее время слышу  про коронавирус , что люди с R1a меньше болеют этим вирусом или меньше умирают . ???????

[Ravnur]

В последнее время слышу  про коронавирус , что люди с R1a меньше болеют этим вирусом или меньше умирают . ???????

 

Левым, правым или обоими ушами слышите?

 

Если такое и имеет место, то это не из-за Y-гаплогруппы, а потому что в странах, где много R1a не было (пока?) очень серьёзных вспышек. Другого объяснения я не вижу. Кто-то от кого вы это услышали путает причину со следствием.

 

А так и по мировой статистике обмороженных можно сделать вывод, что чернокожие не замерзают при минус тридцати.

[Grad]

В последнее время слышу  про коронавирус , что люди с R1a меньше болеют этим вирусом или меньше умирают . ???????

В Норвегии R1a больше 25 процентов, а смертность и заболеваемость примерно на уровне Израиля при сопоставимой численности населения, но при этом много большей площади расселения людей. Да и кто выявлял гаплогруппы заболевших и умерших? Это все современные слухи и сплетни.

[Ravnur]

Да и кто выявлял гаплогруппы заболевших и умерших?

 

Никто, разумеется, но тут логика была иная. В Восточной Европе сильно не полыхает, а там много R1a, а значит у них резистентность.

Мой пример с обмороженными построен по такой же логике.

[Grad]

Никто, разумеется, но тут логика была иная. В Восточной Европе сильно не полыхает, а там много R1a, а значит у них резистентность.

Мой пример с обмороженными построен по такой же логике.

Однако Иран полыхал недавно, а там R1a 15%. При 80 миллионном населении это немало, может среди заболевших и умерших были R1a, мы же не знаем.

[AndrejGS]

Так то русских исследовали, и с гаплогруппами все более или менее ясно. А с убыхами до сих пор не было.

https://www.balto-sl...973#entry328114

Так у меня Балоновкая ассоциироваться с проектом Генографик 2005-2012 годов. Когда у представителей разных народов брали образцы крови. И что мы имеем на 2020 год? Опять процитирую Е. Балановскау: 
 

Проблема в том, что к гаплогруппе R1a принадлежит так много образцов из Северной Евразии, что это представляет собой большой дорогостоящий проект — субтипировать ВСЕ эти образцы и определить, где в Северной Евразии распространены какие субветви R1a

С гаплогруппой R1a эта работа только начата — подождем результаты.

p.s. Для тех кто забыл что из себя представлял проект Генографик

 

Сообщение изменено: AndrejGS, 20 Апрель 2020 - 14:44.

[Краки Нифлунг]

Сейчас наверное коммерческое тестирование и то больше дает.
Но я все равно не понял сути замечания. Вместо убыхов нужно было русских исследовать?
Я то может и не прочь углубления исследования русских, но не вижу ничего такого, что исследовали какой-то там малочисленный народ.

[AndrejGS]

R1а не только русские. Да я сомневаюсь что российская наука 8-10 лет времени потратила на изучение только одного малого народа.

Словосочетание "из Северной Евразии" мне напомнило выложенную тут где-то карту древних ДНК на подобии интерактивной карты из "Карта древней ДНК". На которой видно, что западные ученые по сути игнорируют территорию Восточной Польши, Северной Украины, Белоруссии и Центральной России. И если поведение западных ученых понятно. То подобное поведение российских ученых, но уже к современному населению, мне кажется странным. Тут возможно вопросы к кураторам науки от правительства.

[AndrejGS]

Сейчас наверное коммерческое тестирование и то больше дает.

 

И о ком даёт информацию. О тех кто этой темой увлечен и имеет на это средства. А много ли народа на это идет из сельской местности?

Сообщение изменено: AndrejGS, 20 Апрель 2020 - 23:25.

[Краки Нифлунг]

Вирус, возрастом 7000 лет.

Тема вирусов сейчас как никогда актуальна. Почему бы и мне не написать?  Надо ведь разбирать какие-то отложенные статьи, о которых хотелось бы рассказать.  Речь пойдет не о коронавирусе, а о более знакомой нынешним людям болезни. Это гепатит B. Не тот, который желтуха, а тот, который передается через кровь и другие физиологические жидкости.  Немецкие ученые из Йены изучили материал из зубов 53 древних скелетов и  предоставили результаты исследования геномов трех  людей, обнаруженных на археологических памятниках Германии. Из них двое неолитических фермеров - представитель культуры ленточно-линейной керамики из Карлсдорфа  (5056—4959 до н.э.) и  человек культуры воронковидных кубков из Сорсума (3335—3107 до н.э.).  Третий исследованный  из средневекового кладбища Петерсберга (1020—1116 н.э).  Все они были инфицированы гепатитом В. А для сравнения взяли образцы из итальянских  и корейских мумифицированных останков 16-18 вв.

В результате, выяснилось, что

Свернуть

штаммы вируса отчетливо сгруппировались по эпохам. Но штамм, обнаруженный  у людей неолита ближе к вирусу, который инфицирует горилл и шимпанзе, а у средневекового немца – к тому, что заражает современных людей.  Но и в последнем случае он представляет собой отдельный подтип, отличаясь от вируса, обнаруженного даже в мумиях 17 века из Кореи.  Неолитический штамм отчетливо группируется с штаммами африканских обезьян. Причем у представителей двух разных культур он один.

Выходит, что гепатиту B не менее 7000 лет. А судя по близости  древних штаммов к вирусу шимпанзе и горилл,  все эти болячки получили распространение в неолите, только недавно «перепрыгнув» с животных носителей.

Ах да. Попутно авторы еще провели анализ неолитических геномов и определили их близость к другим древним образцам.

Статья по ссылке

Neolithic and medieval virus genomes reveal complex evolution of hepatitis B.

https://www.ncbi.nlm...pubmed/29745896

[komrad13]

 

Хоть и видео в первую очередь посвящено вымышленным инопланетным организмам, в нем подробно объясняется, как в реальности работают гены, как формируются органы на различных стадиях развития организма. Также в видео рассказывают о таком феномене, когда организмы с абсолютно идентичным набором генов могут сильно отличаться внешне и внутренне  - от различий окраски и формы рогов и вплоть до того, что пол будущего существа может определяться не набором хромосом, а температурой окружающей среды.

[Краки Нифлунг]

О быках и козлах

Скотоводство сыграло не меньшую роль, чем земледелие в процессе становления человеческих обществ. Оба явления произошли примерно в одно и то же время, около 10 000 лет назад.   Помимо человеческой ДНК,  сейчас активно изучают и животную.  Анализ современных бурёнок не прояснил их происхождение, а вот древние образцы внесли ясность в этот вопрос.
Ученые исследовали 67 древних костяков из Ближнего Востока, представляющих корову (Bos Taurus). Выяснилось, что

Свернуть

несколько популяций древних туров (auroch) дали начало современному крупному рогатому скоту.  Самый ранние коровы не содержали примесей индийской зебу Bos indicus, но разные линии происхождения смешались где-то в долине Инда около 4000 лет назад.  После этого времени наблюдается повсеместный прирост генома зебу во всех коровьих стадах мира.  И это несмотря на то, что много тысяч лет зебу и другие коровы сущестовали параллельно. Исследователи посчитали, что это может быть связано с обширной засухой, затронувшей Ближний Восток 4,2 тыс. назад, после которой адаптированные к такому климату зебу оказались весьма востребованы.

Под А ситуация до 2000 г.  Под В - после. Оранжеые цвет отражает долю генома зебу.

 

Но это еще не все. Секвенирование образцов древних туров позволило уточнить происхождение домашней коровы.  Их сходство с ранним крупным рогатым скотом из Анатолии не оставляет сомнения в вопросе о первичном регионе одомашнивания. Однако, местные туры внесли свой вклад в геном древних буренок в Юго-Восточной Европе и Леванте.  А с добавкой зебу около 2000 г. до н.э. получилась наша современная корова.

По козам исследование выходило два года назад, в 2018.  Место действия и время то же – Плодородный Полумесяц, 10 000 лет назад.  Чтобы получился современный козлик, понадобилось одомашнить диких животных в трех разных концах Ближнего Востока.

 

Исследования братьев наших меньших

Коровы:

https://www.ncbi.nlm...pubmed/31296769

https://science.scie..._Verdugo_SM.pdf

https://phys.org/new...ver-cattle.html

Козы

https://science.scie...ent/361/6397/85

[Indiana Jones]

Я не знаю, постили это, или нет...

 

Схема родства и смешения палеолитических и мезолитических групп популяций Западной Евразии :

 

 

 

[Indiana Jones]

Нашел такую схему 

 

= карта популяций Европы и Ближнего Востока в соответствии с данными калькулятора К6

 

= структуризация по шести компонентам ( Ancestral North Eurasian / Ancestral South Eurasian / East Asian / West European Hunter Gatherer / Natufian / SubSaharan )

 

 

Левая сторона = максимум WEHG / UHG ( ??? )

 

Правая сторона = максимум Basal Eurasian / Natufian  ( ??? )

 

Нижняя сторона = максимум ANE  ( ??? )

 

Верхняя сторона = минимум ANE ( ??? )

 

 

[Indiana Jones]

Аргентинцы ( 127 результатов )

 

35 результатов отображают 90%+ происхождение Европа и Ближний Восток ( из них 2 персонажа имеют 100%(!!!) происхождения со Старого Света )

 

5 результатов отображают 50%+ аборигенного происхождения 

 

87 результатов отображают разброс от 50% до 90% происхождения со Старого Света, от 10% до 50% происхождения индейцев Нового Света и от 1% до 8% африканского происхождения ( субСахара + СВ Африка )

 

С одной стороны, такой расклад соответствует результатам геногеографических исследований, моделировавших происхождение аргентинцев как 2/3 Старого Света + 1/3 Нового Света 

 

С другой стороны, стоит обратить внимание на большое количество ( 1/4 персонажей ) людей с четкой европейской доминантой (90%+) 

 

 

 

 

 

А пользователь форума theApricity под ником Argentano отделил результаты с происхождением Старого Света 90%+ и вынес их на геногеографическую схему...

 

Интересно, что многие результаты оказались между Северной Италией и Австрией/Германией. Это еще более любопытно в контексте того, что в Старом Свете нет этносов с подобной пропорцией компонентов ( ближе всего Swiss Italian, не представленные здесь, но они очень далеки от германских народов ).

 

Еще интересно выделяется результат Tere ( между басками и сардинцами...)...

 

 

 

[Хаджимурад]

На форуме Italicroots нашёл очень интересные карты и схемы (правда довольно упрощённые). 

    

Сообщение изменено: Хаджимурад, 06 Июль 2020 - 19:17.

[Хаджимурад]