Перейти к содержимому

Добро пожаловать на Balto-Slavica, форум о Восточной Европе.
Зарегистрируйтесь, чтобы получить доступ ко всем нашим функциям. Зарегистрировавшись, вы сможете создавать темы, отвечать в существующих темах, получить доступ к другим разделам и многое другое. Это сообщение исчезнет после входа.
Войти Создать учётную запись
Фотография

Y-хромосома и общегеномная картина


  • Пожалуйста, авторизуйтесь, чтобы ответить
77 ответов в этой теме

#61
galychanyn

galychanyn

    Постоянный участник

  • Пользователи
  • PipPipPip
  • 1 907 сообщений
  • Национальность:-
  • Фенотип: -
  • Y-ДНК:-
  • мтДНК:-
  • Вероисповедание:-
Цитата
Сомневаюсь. В китайцев 2 основных компоненты - в европейцев - как минимум в 3 раза больше.

Но я же изменил свою позицию по части количества компонентов и остался при прежней по части расстояния между ханьцами:
Цитата
Согласен по части расстояний. К примеру в одной популяции 99% компоненты А и 1% компоненты Б, а у другой - наоборот. Расстояние будет гигантским.
Касательно китайцев я Вам привел карту - на ней 112 китайцев как северных, так и южных. Одновременно на карте присутствуют и европейские популяции. Думаю, что каждый сможет сравнить.


#62
galychanyn

galychanyn

    Постоянный участник

  • Пользователи
  • PipPipPip
  • 1 907 сообщений
  • Национальность:-
  • Фенотип: -
  • Y-ДНК:-
  • мтДНК:-
  • Вероисповедание:-
Вот еще один этноплот:


http://dienekes.blog...-admixture.html

#63
Vadim Verenich

Vadim Verenich

    Участник

  • Пользователи
  • PipPip
  • 425 сообщений
  • Пол:мужской
  • Национальность:50%-полешук 50%-беларус
  • Фенотип: понтид
  • Y-ДНК:I2a1b1
  • мтДНК:J1c
  • Вероисповедание:буддизм
Я так понимаю, основной вопрос звучит так

Цитата
действительно европейцы более гомогенны, чем популяции Азии?


Закавыка в ответе на этот вопрос состоит в том, что понимать под гомогенностью.
Классической мерой гомогенности в попгенетике является уровень гомозиготности.


На эту тему есть хорошая работа 2010 года "Genomic Runs of Homozygosity Record PopulationHistory and Consanguinity", в которой анализировалась структура ROH - гетерозиготных сегментов- в геномах представителей разных популяций (в том числе китайцев).

Цитата
The human genome is characterised by many runs of homozygous genotypes, where identical haplotypes were inherited from each parent. The length of each run is determined partly by the number of generations since the common ancestor: offspring of cousin marriages have long runs of homozygosity (ROH), while the numerous shorter tracts relate to shared ancestry tens and hundreds of generations ago. Human populations have experienced a wide range of demographic histories and hold diverse cultural attitudes to consanguinity. In a global population dataset, genome-wide analysis of long and shorter ROH allows categorisation of the mainly indigenous populations sampled here into four major groups in which the majority of the population are inferred to have: (a) recent parental relatedness (south and west Asians); (b) shared parental ancestry arising hundreds to thousands of years ago through long term isolation and restricted effective population size (Ne), but little recent inbreeding (Oceanians); © both ancient and recent parental relatedness (Native Americans); and (d) only the background level of shared ancestry relating to continental Ne (predominantly urban Europeans and East Asians; lowest of all in sub-Saharan African agriculturalists), and the occasional cryptically inbred individual. Moreover, individuals can be positioned along axes representing this demographic historic space. Long runs of homozygosity are therefore a globally widespread and under-appreciated characteristic of our genomes, which record past consanguinity and population isolation and provide a distinctive record of the demographic history of an individual's ancestors. Individual ROH measures will also allow quantification of the disease risk arising from polygenic recessive effects.


Как видно из приведенной ссылки, восточные азиаты (куда входят видимо и ханьцы) и европейцы относятся к одной категории, характеризующейся фоновым уровнем общего происхождения, относящегося к континентальной эффективной популяции (Ne). То есть с точки зрения гомозиготности, они относятся к одной категории.

В аттачменте приведены статистические данные по ROH-сегментам при разных пороговых значениях
Population
no threshold >0.04 cM >0.05 cM >0.06 cM >0.1cM >0.5 cM >1 cM >2 cM >5 cM
Adygei 4.0152 3.8625 3.8596 3.8449 3.7752 1.5821 0.6906 0.4771 0.2978
Basque 5.4703 5.2825 5.2756 5.2688 5.1813 2.6805 1.4127 0.8059 0.2558
French 4.2608 4.0796 4.0786 4.0702 3.9923 1.5120 0.4938 0.2866 0.2054
Italia 4.6552 4.5177 4.5177 4.5128 4.4158 1.9931 1.0776 0.8631 0.6644

Russian 4.1194 3.9581 3.9562 3.9529 3.8878 1.4931 0.4183 0.1541 0.0250
Sardinian 5.3196 5.0972 5.0930 5.0849 5.0127 2.4353 1.1416 0.7207 0.3021
Tuscan 3.7727 3.5702 3.5663 3.5632 3.4880 1.3146 0.3246 0.1493 0.1017


Mongol 4.2446 4.1162 4.1162 4.1107 3.9982 1.2844 0.1895 0.0507 0.0100
Han 4.7277 4.5792 4.5753 4.5690 4.4733 1.5091 0.2242 0.0238 0.0036


Как виде цифры примерно одинаковы

Для сравнения

Bedouin 7.1589 6.9066 6.9040 6.8997 6.8307 4.9140 4.0001 3.3658 2.1784
Colombian 15.0126 14.5989 14.5989 14.5989 14.5020 10.4331 6.2256 3.9881 2.7625
Karitiana 20.5416 19.8365 19.8357 19.8316 19.7575 15.5160 10.8608 8.1562 5.3507
Maya 9.3244 8.9956 8.9937 8.9849 8.9041 5.1461 1.6904 0.4815 0.3055
Pima 16.1817 15.6636 15.6625 15.6524 15.5742 11.8951 7.9883 5.9443 4.0999
Melanesian 10.7464 10.3808 10.3724 10.3699 10.2822 6.3807 3.0053 1.1444 0.3299
Papuan 12.7762 12.4377 12.4377 12.4308 12.3563 7.8225 3.7670 1.8569 0.7512

и на другом конце спектра

Bantu 1.8139 1.7698 1.7698 1.7673 1.7228 1.2066 0.8140 0.5032 0.2162
Biaka Pygmies 2.8909 2.7718 2.7706 2.7679 2.7301 2.2412 1.8371 1.1928 0.3497
Mandenka 1.8155 1.7559 1.7546 1.7521 1.7208 0.9700 0.6272 0.5205 0.3731
Yoruba 1.6059 1.5335 1.5309 1.5309 1.4763 0.7508 0.3255 0.1380 0.0686
Когда не думаешь, многое становится ясным (с) Виктор Пелевин - Generation P
Если вы стараетесь ни о чем не думать и постоянно заставляете свои мысли исчезать, значит, вы попали в путы учения. Это называется ограничен­ностью взглядов.Тот, кто пробудился в учении о не-мысли, созерцает миры всех будд. Тот, кто пробудился во внезапном учении о нё-мысли, достигает состояния будды. (с) Вон Кью-Кит

#64
Padre Organtino

Padre Organtino

    Новичок

  • Пользователи
  • Pip
  • 40 сообщений
  • Национальность:Грузин
  • Фенотип: Мтебид-Альпинид?
  • Вероисповедание:Агностик с Православными корнями
Y-хромосомные исследования оказали крайне нездоровое влияние на лиц, склонных к фолк-хистори.
Кстати говоря в контексте Европы генетические расстояния действительно сильно коррелированы с географическими, что свидетельствует о сравнительной однородности европейцев.

Сообщение изменено: Padre Organtino, 20 Сентябрь 2012 - 12:51.


#65
Пастор_Шлаг

Пастор_Шлаг

    Участник

  • Пользователи
  • PipPipPipPipPip
  • 5 477 сообщений
  • Пол:мужской
  • Национальность:-
  • Фенотип: -
  • Вероисповедание:-
Цитата(Padre Organtino @ 20.9.2012, 16:48) (смотреть оригинал)
Y-хромосомные исследования оказали крайне нездоровое влияние на лиц, склонных к фолк-хистори.


Какие исследования на них влияния не оказали? smile.gif

Но до лингвофриков в целом далеко.

#66
Padre Organtino

Padre Organtino

    Новичок

  • Пользователи
  • Pip
  • 40 сообщений
  • Национальность:Грузин
  • Фенотип: Мтебид-Альпинид?
  • Вероисповедание:Агностик с Православными корнями
Цитата(Пастор_Шлаг @ 20.9.2012, 17:18) (смотреть оригинал)
Какие исследования на них влияния не оказали? smile.gif

Но до лингвофриков в целом далеко.


Дело в том, что любительский взгляд на Y-хромосомные распределения у соседних народов говорящих на разных языках может создать иллюзию большой "расовой" разницы между народами с почти идентичным генофондом.

#67
Пастор_Шлаг

Пастор_Шлаг

    Участник

  • Пользователи
  • PipPipPipPipPip
  • 5 477 сообщений
  • Пол:мужской
  • Национальность:-
  • Фенотип: -
  • Вероисповедание:-
Цитата(Padre Organtino @ 20.9.2012, 17:34) (смотреть оригинал)
Дело в том, что любительский взгляд на Y-хромосомные распределения у соседних народов говорящих на разных языках может создать иллюзию большой "расовой" разницы между народами с почти идентичным генофондом.


Пример можно?

#68
Padre Organtino

Padre Organtino

    Новичок

  • Пользователи
  • Pip
  • 40 сообщений
  • Национальность:Грузин
  • Фенотип: Мтебид-Альпинид?
  • Вероисповедание:Агностик с Православными корнями
Цитата(Пастор_Шлаг @ 20.9.2012, 20:19) (смотреть оригинал)
Пример можно?


Финноугорские балты,арийские киргизы,грузины в Сардинии,укротюрки и т.д.

#69
Пастор_Шлаг

Пастор_Шлаг

    Участник

  • Пользователи
  • PipPipPipPipPip
  • 5 477 сообщений
  • Пол:мужской
  • Национальность:-
  • Фенотип: -
  • Вероисповедание:-
Цитата(Padre Organtino @ 20.9.2012, 21:00) (смотреть оригинал)
Финноугорские балты,арийские киргизы,грузины в Сардинии,укротюрки и т.д.


Это не примеры, какие-то ксенофобско-фрические штампы. Можно корректно и с частотами гг?

#70
Padre Organtino

Padre Organtino

    Новичок

  • Пользователи
  • Pip
  • 40 сообщений
  • Национальность:Грузин
  • Фенотип: Мтебид-Альпинид?
  • Вероисповедание:Агностик с Православными корнями
Цитата(Пастор_Шлаг @ 20.9.2012, 21:13) (смотреть оригинал)
Это не примеры, какие-то ксенофобско-фрические штампы. Можно корректно и с частотами гг?


Именно поэтому я и написал "фолк хистори".

#71
Пастор_Шлаг

Пастор_Шлаг

    Участник

  • Пользователи
  • PipPipPipPipPip
  • 5 477 сообщений
  • Пол:мужской
  • Национальность:-
  • Фенотип: -
  • Вероисповедание:-
Цитата(Padre Organtino @ 21.9.2012, 1:49) (смотреть оригинал)
Именно поэтому я и написал "фолк хистори".


Я про эту фразу:

Цитата
почти идентичным генофондом


кто такие?

#72
Skalagrim

Skalagrim

    Nobody

  • Супермодераторы
  • PipPipPipPipPip
  • 23 855 сообщений
  • Пол:мужской
  • Город:------------------
  • Национальность:-----
  • Фенотип: --------
  • Y-ДНК:-
  • мтДНК:--
  • Вероисповедание:Смерть фашистским оккупантам!
Цитата(Padre Organtino @ 20.9.2012, 16:34) (смотреть оригинал)
Дело в том, что любительский взгляд на Y-хромосомные распределения у соседних народов говорящих на разных языках может создать иллюзию большой "расовой" разницы между народами с почти идентичным генофондом.

Цитата(Пастор_Шлаг @ 21.9.2012, 9:42) (смотреть оригинал)
Я про эту фразу:



кто такие?

Например эстонцы с одной стороны и литовцы/латыши с другой.

#73
Пастор_Шлаг

Пастор_Шлаг

    Участник

  • Пользователи
  • PipPipPipPipPip
  • 5 477 сообщений
  • Пол:мужской
  • Национальность:-
  • Фенотип: -
  • Вероисповедание:-
Цитата(Skalagrim @ 21.9.2012, 12:00) (смотреть оригинал)
Например эстонцы с одной стороны и литовцы/латыши с другой.


И какова степень идентичности генофонда, чем оценивается и как?

#74
Пастор_Шлаг

Пастор_Шлаг

    Участник

  • Пользователи
  • PipPipPipPipPip
  • 5 477 сообщений
  • Пол:мужской
  • Национальность:-
  • Фенотип: -
  • Вероисповедание:-
Вот например здесь какова степень идентичности?



#75
RUMALI

RUMALI

    Ветеран

  • Заблокированные
  • PipPipPipPipPip
  • 5 185 сообщений
  • Пол:мужской
  • Город:Самара
  • Национальность:Русский
  • Фенотип: Палеоевропеоид
  • Вероисповедание:Православный
Цитата(Пастор_Шлаг @ 21.9.2012, 12:59) (смотреть оригинал)
Вот например здесь какова степень идентичности?


А есть ли вероятность, что идентичность "выровняется", если увеличить выборки ?
Никогда не забывай откуда Ты, иначе в один прекрасный день забудешь - кто Ты.

#76
Пастор_Шлаг

Пастор_Шлаг

    Участник

  • Пользователи
  • PipPipPipPipPip
  • 5 477 сообщений
  • Пол:мужской
  • Национальность:-
  • Фенотип: -
  • Вероисповедание:-
Цитата(RUMALI @ 21.9.2012, 13:14) (смотреть оригинал)
А есть ли вероятность, что идентичность "выровняется", если увеличить выборки ?


Если довести до 100-150 образцов может быть. То что устаканится на 100-150 уже на 200-1000 меняться не будет.

#77
Padre Organtino

Padre Organtino

    Новичок

  • Пользователи
  • Pip
  • 40 сообщений
  • Национальность:Грузин
  • Фенотип: Мтебид-Альпинид?
  • Вероисповедание:Агностик с Православными корнями
Цитата(Пастор_Шлаг @ 21.9.2012, 12:54) (смотреть оригинал)
И какова степень идентичности генофонда, чем оценивается и как?


Обратите внимание на сказанное Вадимом Вареничем:


"В популяционной генетике наиболее общепринятой мерой генетической дистанции между отдельными популяциями является F-статистка Райта, а точнее - индекс фиксации (Fst), который по определению отличается от упомянутого Валерием "генетического расстояния Нея".

Индекс фиксации принимает минимальное значение 0 и максимальное 1. Значение 0 говорит о генетической идентичности, а величина 1 говорит о том, что две популяции являются разными видами."

Так вот этот индекс для русских и эстонцев если мне не изменяет память принимает значение равное 0,1 и заметно меньше аналогичного для эстонцев и финнов. Такой уровень Fst говорит о том, что мы имеем дело с практически одинаковыми генетически популяциями. Для эстонцев и латышей разница скорее всего будет вообще пренебрежимо малой.

Сообщение изменено: Padre Organtino, 22 Сентябрь 2012 - 12:08.


#78
RUMALI

RUMALI

    Ветеран

  • Заблокированные
  • PipPipPipPipPip
  • 5 185 сообщений
  • Пол:мужской
  • Город:Самара
  • Национальность:Русский
  • Фенотип: Палеоевропеоид
  • Вероисповедание:Православный
Цитата(Padre Organtino @ 22.9.2012, 15:25) (смотреть оригинал)
Обратите внимание на сказанное Вадмом Вареничем:


"В популяционной генетике наиболее общепринятой мерой генетической дистанции между отдельными популяциями является F-статистка Райта, а точнее - индекс фиксации (Fst), который по определению отличается от упомянутого Валерием "генетического расстояния Нея".

Индекс фиксации принимает минимальное значение 0 и максимальное 1. Значение 0 говорит о генетической идентичности, а величина 1 говорит о том, что две популяции являются разными видами."

Так вот этот индекс для русских и эстонцев если мне не изменяет память принимает значение равное 0,1 и заметно меньше аналогичного для эстонцев и финнов. Такой уровень Fst говорит о том, что мы имеем дело с практически одинаковыми генетически популяциями. Для эстонцев и латышей разница скорее всего будет вообще пренебрежимо малой.

Антропологические данные тоже говорят о близости популяций.
Никогда не забывай откуда Ты, иначе в один прекрасный день забудешь - кто Ты.


Посетителей, читающих эту тему: 1

0 пользователей, 1 гостей, 0 анонимных пользователей